Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRAPPC8Q9Y2L5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms