Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SBNO2Q9Y2G9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms