Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GNEQ9Y223 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms