Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FZD1Q9UP38 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FZD1Q9UP38 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms