Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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USP18Q9UMW8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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USP18Q9UMW8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
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