Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PNMA8BQ9ULN7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PNMA8BQ9ULN7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PNMA8BQ9ULN7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PNMA8BQ9ULN7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PNMA8BQ9ULN7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PNMA8BQ9ULN7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PNMA8BQ9ULN7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PNMA8BQ9ULN7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PNMA8BQ9ULN7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PNMA8BQ9ULN7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PNMA8BQ9ULN7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PNMA8BQ9ULN7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PNMA8BQ9ULN7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PNMA8BQ9ULN7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PNMA8BQ9ULN7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PNMA8BQ9ULN7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PNMA8BQ9ULN7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PNMA8BQ9ULN7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PNMA8BQ9ULN7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PNMA8BQ9ULN7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PNMA8BQ9ULN7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PNMA8BQ9ULN7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PNMA8BQ9ULN7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PNMA8BQ9ULN7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PNMA8BQ9ULN7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PNMA8BQ9ULN7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PNMA8BQ9ULN7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PNMA8BQ9ULN7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PNMA8BQ9ULN7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PNMA8BQ9ULN7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PNMA8BQ9ULN7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PNMA8BQ9ULN7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PNMA8BQ9ULN7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PNMA8BQ9ULN7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PNMA8BQ9ULN7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PNMA8BQ9ULN7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PNMA8BQ9ULN7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PNMA8BQ9ULN7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PNMA8BQ9ULN7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PNMA8BQ9ULN7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PNMA8BQ9ULN7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PNMA8BQ9ULN7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PNMA8BQ9ULN7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PNMA8BQ9ULN7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PNMA8BQ9ULN7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PNMA8BQ9ULN7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PNMA8BQ9ULN7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PNMA8BQ9ULN7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PNMA8BQ9ULN7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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