Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL16

CFAP45, Cilia- and flagella-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP45Q9UL16 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP45Q9UL16 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP45Q9UL16 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP45Q9UL16 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP45Q9UL16 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP45Q9UL16 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP45Q9UL16 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP45Q9UL16 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP45Q9UL16 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP45Q9UL16 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP45Q9UL16 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP45Q9UL16 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP45Q9UL16 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP45Q9UL16 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP45Q9UL16 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP45Q9UL16 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP45Q9UL16 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP45Q9UL16 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP45Q9UL16 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms