Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms