Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms