Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY6

TRIM10, Tripartite motif-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM10Q9UDY6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms