Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms