Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139 ms