Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXV6

CDKN2AIP, CDKN2A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2AIPQ9NXV6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKN2AIPQ9NXV6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKN2AIPQ9NXV6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKN2AIPQ9NXV6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKN2AIPQ9NXV6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKN2AIPQ9NXV6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKN2AIPQ9NXV6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKN2AIPQ9NXV6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKN2AIPQ9NXV6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKN2AIPQ9NXV6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKN2AIPQ9NXV6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms