Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A12Q9NXJ0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms