Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms