Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT57Q9NWB7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT57Q9NWB7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
IFT57Q9NWB7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
IFT57Q9NWB7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFT57Q9NWB7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms