Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms