Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms