Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF275Q9NSD4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms