Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms