Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TOPORSQ9NS56 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms