Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
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