Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH2B1Q9NRF2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SH2B1Q9NRF2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH2B1Q9NRF2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH2B1Q9NRF2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH2B1Q9NRF2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH2B1Q9NRF2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH2B1Q9NRF2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH2B1Q9NRF2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH2B1Q9NRF2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH2B1Q9NRF2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH2B1Q9NRF2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH2B1Q9NRF2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH2B1Q9NRF2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH2B1Q9NRF2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH2B1Q9NRF2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH2B1Q9NRF2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH2B1Q9NRF2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH2B1Q9NRF2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH2B1Q9NRF2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH2B1Q9NRF2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH2B1Q9NRF2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH2B1Q9NRF2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH2B1Q9NRF2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH2B1Q9NRF2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH2B1Q9NRF2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH2B1Q9NRF2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH2B1Q9NRF2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH2B1Q9NRF2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH2B1Q9NRF2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH2B1Q9NRF2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH2B1Q9NRF2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH2B1Q9NRF2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH2B1Q9NRF2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH2B1Q9NRF2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH2B1Q9NRF2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH2B1Q9NRF2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SH2B1Q9NRF2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH2B1Q9NRF2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH2B1Q9NRF2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH2B1Q9NRF2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms