Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
INCENPQ9NQS7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms