Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms