Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms