Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPCPD1Q9NPB8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms