Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms