Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.86
USP29Q9HBJ7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms