Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CLSPNQ9HAW4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms