Protein–RNA interactions for Protein: Q9H173

SIL1, Nucleotide exchange factor SIL1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIL1Q9H173 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIL1Q9H173 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIL1Q9H173 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIL1Q9H173 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIL1Q9H173 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SIL1Q9H173 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIL1Q9H173 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIL1Q9H173 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIL1Q9H173 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIL1Q9H173 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIL1Q9H173 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIL1Q9H173 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms