Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLIRPQ9GZT3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms