Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms