Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDGFDQ9GZP0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
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