Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL4Q9C0H6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms