Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms