Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNTNAP4Q9C0A0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
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