Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYW2

SETD2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD2Q9BYW2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SETD2Q9BYW2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SETD2Q9BYW2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SETD2Q9BYW2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
SETD2Q9BYW2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SETD2Q9BYW2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SETD2Q9BYW2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
SETD2Q9BYW2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SETD2Q9BYW2 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
SETD2Q9BYW2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
SETD2Q9BYW2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
SETD2Q9BYW2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SETD2Q9BYW2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SETD2Q9BYW2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SETD2Q9BYW2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SETD2Q9BYW2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SETD2Q9BYW2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SETD2Q9BYW2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SETD2Q9BYW2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SETD2Q9BYW2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SETD2Q9BYW2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SETD2Q9BYW2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SETD2Q9BYW2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SETD2Q9BYW2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SETD2Q9BYW2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SETD2Q9BYW2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SETD2Q9BYW2 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SETD2Q9BYW2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SETD2Q9BYW2 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SETD2Q9BYW2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SETD2Q9BYW2 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SETD2Q9BYW2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SETD2Q9BYW2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SETD2Q9BYW2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SETD2Q9BYW2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms