Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC9.34□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms