Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms