Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HIGD2AQ9BW72 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms