Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
C1orf50Q9BV19 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C1orf50Q9BV19 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C1orf50Q9BV19 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C1orf50Q9BV19 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
C1orf50Q9BV19 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C1orf50Q9BV19 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C1orf50Q9BV19 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C1orf50Q9BV19 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C1orf50Q9BV19 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C1orf50Q9BV19 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
C1orf50Q9BV19 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C1orf50Q9BV19 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C1orf50Q9BV19 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C1orf50Q9BV19 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C1orf50Q9BV19 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C1orf50Q9BV19 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C1orf50Q9BV19 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1orf50Q9BV19 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1orf50Q9BV19 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1orf50Q9BV19 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
C1orf50Q9BV19 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1orf50Q9BV19 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1orf50Q9BV19 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1orf50Q9BV19 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1orf50Q9BV19 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
C1orf50Q9BV19 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1orf50Q9BV19 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1orf50Q9BV19 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1orf50Q9BV19 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
C1orf50Q9BV19 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1orf50Q9BV19 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms