Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms