Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLF1Q9BQI6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms