Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms