Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms