Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms