Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX18Q96RF0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms