Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ALS2CR12Q96Q35 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms