Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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